أولاّ  برنامج تحسين أوضاع السجون :

يقوم هذا البرنامج علي رصد أوضاع المسجونين و إصدار تقارير نوعية حول الانتهاكات التي يتعرضون لها بالمخالفة لقواعد الحد الأدنى لمعاملة السجناء وكافة المواثيق الدولية.

ثانياّ : برنامج المساعدة القانونية :

وفيه يقوم المركز بالتحرك فى الشكاوى التى يتلقاها ويهدف من ذلك التحرك الدفاع عن حقوق المسجونين وذلك بعدة وسائل :   

1-     تقديم البلاغات للنائب العام ووزارة الداخلية و مصلحة السجون .

2-     رفع الدعاوى القضائية للسجناء و أسرهم في إطار تحسين أوضاعهم المعيشية و الصحية و التعليمية داخل السجون ورفع قضايا التعويض لمن تم حبسهم أو اعتقالهم بدون وجه حق و تعرضوا للتعذيب أو المعاملة القاسية

ثالثاّ: برنامج المساعدة التعليمية : 

ويتم فيه مساعدة السجناء و أبنائهم غير القادرين في استكمال تعليمهم بدفع الرسوم الدراسية و شراء الكتب و الأدوات الدراسية .

رابعاّ : برنامج البحث القانونية و حقوق الإنسان :

       1-     إصدار سلسة من الكتب و المطبوعات التي تعرف المواثيق الدولية لحقوق الإنسان .

2-     تنظيم ورش عمل و ندوات لمناقشة أوضاع السجون و السجناء .

3-     تناول المشكلات القانونية المتعلقة بالسجون و السجناء بالبحث و الدراسة .

خامساّ : برنامج التدريب :

وفيه يقوم المركز بتنظيم دورات تدريبيه للمحامين لتعريفهم بحقوق السجناء وكيفية الدفاع عن تلك الحقوق.